Nació en Valencia. En 1980 Nacho Duato firmó su primer contrato con el Cullberg Ballet y, un año después, de la mano de Jirí Kylián, ingresó en el Nederlands Dans Theater, compañía de la que fue nombrado coreógrafo estable en 1988.

Por sus éxitos como bailarín recibió en 1987 el VSCD Gouden Dansprijs (Premio de Oro de la Danza). Su primera coreografía, Jardí Tancat (1983) ganó el primer premio en el Internationaler Choreographischer Wettbewerb de Colonia.

Nacho Duato ha recibido múltiples premios como coreógrafo: Chevalier de l’Ordre des Arts et des Lettres de la embajada de Francia en España en 1995, la medalla de oro de Bellas Artes del gobierno español en 1998, Benois de la Danse en 2000 y el Premio Nacional de Danza de coreografía en 2003. Además, el Departamento de Asuntos Exteriores español le otorgó la Medalla al Mérito Civil. En 2015, recibió el premio de la ciudad de Alcalá para las artes y la literatura. En 2016, se convirtió en ciudadano de honor de su ciudad natal, Valencia.

Dirigió la Compañía Nacional de Danza de 1990 a 2010.

Desde 2011 a 2015 dirigió el Ballet del Teatro Mikhailovski en San Petersburgo. A partir de la temporada 2014/2015, Nacho Duato se convierte en Director Artístico de Staatsballett Berlín. Después de poner en escena sus coreografías La Bella Durmiente, Multiplicidad. Formas de silencio y vacío, White Darkness, Herrumbre, Castrati, El cascanueces y las nuevas piezas: Tiempo estático y Erde, presentó Romeo y Julieta y Por vos muero, en el 2018, año en que deja su puesto en Berlín.

En mayo de 2018 la Compañía Nacional de Danza repuso su ballet Por vos muero en el Teatro de la Zarzuela.

En 2019, 2020 y 2021 ha participado en el programa “PRODIGIOS” como jurado.

En 2020 creará su Fundación y en la actualidad es, de nuevo, en el director del Ballet del Teatro Mikhailovsky en San Petersburgo para el que acaba de estrenar La Bayadere.

Sus ballets forman parte del repertorio de las más prestigiosas compañías de todo el mundo.